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김우주1983년에 고려대학교 의과대학을 졸업하고 1990년 이후 고려대학교 의과대학 구로병원 감염내과에서 전임의를 시작으로 1992년 의학박사, 1993년 정식 교수가 되었다. 1996, 1997년 미국 시카고에 있는 러시대학병원 감염내과에서 연수하며 항생제 내성에 대해서 연구했다. 1999년 국립보건원 호흡기바이러스 과장을 겸직했으며, 국내 최초로 6백여 개 의료기관을 참여시켜 전국적인 인플루엔자 감시망을 구성해 독감의 유행 실태를 파악하는 계기를 만들었다.
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